โรงเรียนประถมเซนต์แมรีเริ่มต้นอย่างเรียบง่ายที่ถนนไฮสตรีทเมื่อวันที่ 10 มีนาคม ค.ศ. 1919 ภายใต้การดูแลของมิสแอนน์ ฮันราฮาน โดยมีนักเรียน 75 คน ปัจจุบันโรงเรียนเซนต์แมรีเติบโตจนมีนักเรียนประมาณ 560 คน และบุคลากรกว่า 80 คน ณ โรงเรียนปัจจุบันบนถนนเมอร์ลองสตรีท
แมรี แมคคิลลอป ร่วมกับจูเลียน เทนิสัน-วูดส์ ก่อตั้งโรงเรียนโจเซฟไฟท์ขึ้น เพื่อให้เด็กๆ ในพื้นที่ห่างไกลและชนบทมีโอกาสเข้าถึงการศึกษาคาทอลิก ในเดือนกรกฎาคม ค.ศ. 1923 การมาถึงของซิสเตอร์แห่งเซนต์โจเซฟสามท่าน ณ สวอนฮิลล์ ถือเป็นจุดเริ่มต้นของความสัมพันธ์อันยาวนานและใกล้ชิดระหว่างโจเซฟไฟท์กับการศึกษาคาทอลิกในสวอนฮิลล์ ในปี ค.ศ. 1923 บิชอปโฟลีย์ได้ประกอบพิธีวางศิลาฤกษ์ของคอนแวนต์หลังใหม่ ซึ่งต่อมารู้จักกันในชื่อบ้านแมคคิลลอป ซึ่งถูกไฟไหม้ในปี ค.ศ. 1989 ระหว่างปี ค.ศ. 1980 ถึง ค.ศ. 1990 ได้มีการบูรณะครั้งใหญ่ ณ บริเวณถนนไฮสตรีท ซึ่งปัจจุบันเป็นที่ตั้งของวิทยาลัยเซนต์แมรี แมคคิลลอป
ประเพณีอันยาวนานที่โรงเรียนเซนต์แมรีมีซิสเตอร์เซนต์โจเซฟเป็นหัวหน้าโรงเรียนได้สิ้นสุดลงในปี พ.ศ. 2539 หลังจากดำเนินกิจการมาเป็นเวลา 73 ปี จึงได้แต่งตั้งครูใหญ่ฝ่ายฆราวาสขึ้นเพื่อเริ่มต้นปีการศึกษา พ.ศ. 2540 อย่างไรก็ตาม ลักษณะนิสัยแบบโจเซฟ ได้แก่ การทำงานหนัก การอุทิศตน ชุมชน และความสามัคคีในครอบครัว ยังคงเป็นคุณลักษณะสำคัญของโรงเรียนของเรา
โรงเรียนแห่งใหม่ตั้งอยู่บนพื้นที่เดิมของ Shamrock Park โดยมีขอบเขตถนน Murlong และ Karinie โครงการก่อสร้างอาคารระยะที่หนึ่งและสองเสร็จสมบูรณ์ในปี พ.ศ. 2539 ทำให้นักเรียนทุกคนสามารถเข้าเรียนในพื้นที่เดียวกันได้ หลังจากที่เป็นโรงเรียนสองวิทยาเขตมาเกือบสองปี ปัจจุบัน โรงเรียนเซนต์แมรีส์ได้รับประโยชน์จากสภาพแวดล้อมการเรียนรู้ที่สดใส สดชื่น และน่าดึงดูดใจ ท่ามกลางบรรยากาศกึ่งชนบทอันเงียบสงบ